Đức và Israel có hợp tác quân sự quan trọng và lâu dài. Từ năm 1959 đến 1967, Cộng hòa Liên bang Đức là nhà cung cấp thiết bị quân sự và vũ khí quan trọng cho Israel.[17]

Tuy nhiên, sau năm 1965, khi Tây Đức từ bỏ thỏa thuận bán xe tăng cho Israel, Hoa Kỳ đã lấp đầy đơn đặt hàng bằng cách bán 210 xe tăng M48 Patton. Merkava 4 sử dụng động cơ V12 diesel làm mát bằng không khí MTU MB 873 Ka-501 của Đức được sản xuất theo giấy phép. Đức đã cung cấp cho Israel các tàu ngầm lớp Cá heo trong khi Đức sử dụng tên lửa chống tăng Spike do Israel thiết kế. Năm 2008, tiết lộ rằng Đức và Israel đã cùng phát triển một hệ thống cảnh báo hạt nhân, được đặt tên là Chiến dịch Bluebird, trong bí mật.[18]

Mối quan hệ chặt chẽ này, được dịch thông qua thỏa thuận vũ khí và chia sẻ thông tin tình báo, đã phát triển thành niềm tin vững chắc và cuối cùng đặt nền tảng cần thiết cho việc thiết lập quan hệ ngoại giao.[19]

Lần đầu tiên trong lịch sử quan hệ hai nước, chiến đấu cơ của Đức đã hạ cánh xuống sân bay Ovda ở Israel để tham gia cuộc tập trận Cờ Xanh vào năm 2017.[20]